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Con el nombre de San Carlos, los fundadores de la institución, pretenden rendir un homenaje, al Real Colegio Seminario de San Carlos, por su importancia en el proceso de la formación cultural de nuestro país. En la época colonial, los sacerdotes más ilustrados del clero criollo y muchos gestores y ejecutores de la Independencia Nacional concurrieron a sus aulas, que abrían a la juventud paraguaya de su tiempo, posibilidades de superación, hasta entonces vedadas.
El Nombre elegido, compromete el esfuerzo de quienes lo dirigen, pues así como el anterior formó a aquellos que iban a desempeñar un papel prominente en los últimos tiempos de la Colonia y en la Revolución de la Independencia, esta Institución haciendo honor a su slogan Revolución Educativa formará a personas en su integridad intelectual y moral, a través de la excelencia como un medio para servir a la sociedad y con ello, contribuir al desarrollo de nuestro Paraguay.
Misión: Formar una generación de lideres positivos y capaces de llevar adelante su comodidad sin ataduras políticas ni económicas.
San Carlos se ha concentrado, exclusivamente, en el desarrollo de la capacitación en el sector agropecuario. Su propósito es incrementar los conocimientos y las aptitudes de quienes participen en sus cursos, seminarios o de sus carreras.
La institución está comprometida con la búsqueda de la excelencia en la educación superior, indispensable para equiparar la formación de nuestros compatriotas a nivel de los demás profesionales de la región. Nuestra cultura agro ganadera nos anima a afirmar que el desarrollo del Paraguay se basa, en gran medida, en el desarrollo del sector agropecuario.
Si bien el desarrollo de cualquier sector impone la capacitación de todos los agentes involucrados, es en el sector agropecuario donde San Carlos propone hacer hincapié, en la formación de mandos medios, técnicos y profesionales, tomando en cuenta que los adelantos técnicos y científicos, las nuevas exigencias de bienes y servicios y el nivel de desarrollo de nuestros socios comunitarios exigen la formación de profesionales capaces de planificar, programar y ejecutar proyectos.
